筒式磁性分离器有机体，在机体上设有进水口、出水口，在机体的一侧设有刮屑板，在刮屑板下方设有导屑槽，特点是，在机体内设有弧形导流板，靠近导流板处设有挡圈和磁筒，两者呈间隔叠加设置，挡圈和磁筒通过转动轴固定在机体上，由设在机体侧面的减速电机控制转动轴转动，磁筒的表面与刮屑板端部靠接，在机体内设有液位传感器，液位传感器通过线束和电气控制盒与减速电机相连，通过在筒体中充填相对免疫磁珠而言直径较大的导磁珠，既能有效地在外置磁场作用下将免疫磁珠连同被标记的细胞吸附在导磁珠上，从而保证分离的有效进行，又由于相对筒体直径而言较小的导磁珠之间间隙的存在，有效地避免了免疫磁珠连同被标记细胞之间的碰撞，从而保证细胞的活性。